Biologiczne oczyszczanie ścieków oparte jest na działaniu osadu czynnego, który jest swoistym ekosystemem złożonym z wielu rodzajów przede wszystkim bakterii i pierwotniaków. Osad czynny funkcjonuje sprawnie w pewnych granicach parametrów fizykochemicznych, takich jak temperatura, pH, poziom tlenu, które mogą być kontrolowane i regulowane.

Jednakże ekosystem ten może zostać rozregulowany poprzez wprowadzenie substancji toksycznych niszczących gatunki wrażliwe bądź tylko zaburzających ich metabolizm lub namnażanie.
Biologiczna ocena jakości ścieków polega na zastosowaniu jako wskaźnika organizmu żywego (bioindykatora), którego reakcja może być podstawą oceny rzeczywistej wielkości obciążeń badanego układu. Metody bioindykacyjne wykorzystują szczególnie wrażliwe szczepy organizmów i wskazują na obecność szkodliwych substancji biologicznie czynnych w stężeniach, które mogą jeszcze nie wpływać na naturalne ekosystemy. Dają pierwszy sygnał, iż badana próbka może być przyczyną niewłaściwego funkcjonowania układu i wymaga dokładniejszej analizy chemicznej.

Mikroorganizmy jako bioindykatory
Mikroorganizmy są bardzo ciekawą grupą bioindykatorów ze względu na wiele ich właściwości. Po pierwsze, wysoka wrażliwość na trucizny komórkowe w połączeniu ze względnie dużą powierzchnią kontaktu ze środowiskiem daje gwarancję szybkiego czasu reakcji. Po drugie, zawarcie wszystkich funkcji życiowych w pojedynczej komórce umożliwia ocenę różnych parametró...