Badania w celu ochrony wód powierzchniowych to niezwykle istotny problem obecnego świata. Jest on ważny ze względu na zmniejszające się zasoby słodkiej wody, ale również na jej jakość. Pogorszyła się ona do tego stopnia, że procesy samooczyszczania są niewystarczające.

Zanieczyszczenia wód to ogół szkodliwych zmian ich cech fizyczno-chemicznych i biologicznych, spowodowany zrzutem nadmiernych ilości ścieków lub ciepła. Uniemożliwiają one wykorzystanie wód do picia i celów gospodarczych. Zanieczyszczenia mogą być pochodzenia naturalnego 
lub antropopresyjnego (bytowe, przemysłowe, rolnicze).
W celu oceny jakości i ochrony rzek przeprowadza się badania wód w oparciu o różne rodzaje wskaźników ich zanieczyszczenia. Obecnie coraz większą wagę przywiązuje się do badań biologicznych, tzw. bioindykacji. Ta metoda oceny stopnia toksyczności wód wykorzystuje żywe organizmy wskaźnikowe, tzw. bioindykatory. W oparciu o nie od wielu lat również firmy wodociągowe stosują różne systemy detekcji skażeń ujmowanych wód.
Bioluminescencja ? żywe latarki
W odmętach oceanu, gdzie panują ciemności, można spotkać wiele gatunków zwierząt specjalnie przystosowanych do tych warunków. Niektóre ryby czy kałamarnice wykorzystują do oświetlania głębin ?żywe? latarki. Są to unikalne narządy świetlne wypełnione bakteriami emitującymi fotony światła o barwie niebiesko-zielonej. Osobliwość ta nosi nazwę bioluminescencji i ...